Jason Bourne (Matt Damon) é um homem sem passado e, talvez, sem futuro. E sem memória. Tudo que ele se lembra é que estava no Mar Mediterrâneo e seu corpo estava cravado de balas. Uma estrutura de microfilme foi cirurgicamente implantada em seu corpo e Bourne tem poucas pistas. Tudo indica que uma plástica alterou seu rosto. Não bastando, o rapaz está sendo perseguido por estranhos que parecem dispostos a tudo para conseguir matá-lo.